会員登録はホームページから行います。 GENOMINEプロテオーム解析サービスページ(http://www.genoproteom.com/o_index_jpn.php)にアクセスし画面左上のサービス依頼分析をクリックいたしますと、ログイン画面が表示されますので、ここから登録を行います。 IDとパスワードを決定していただくほか、お名前、所属機関等必要事項をご入力ください。

※パスワードはお客様にしか分からない形で処理しておりますので、パスワードを忘れないようにご留意ください。パスワードを忘れた場合は、rs@leaveanest.comまでご連絡ください。

<サービス管理について>

GENOMINE ホームページのプロテオーム解析サービス管理システムでは、サンプルの到着、解析の進捗、終了までの全過程をメールで逐次お知らせいたします。終了後にはその結果がダウンロード出来るシステムになっております。

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2 サンプルの準備

MS 分析用( 質量分析用 )サンプルの場合

  • Gel(2-DE gel 又は SDS-PAGE gel)をDW(チリなどの混入が無いようにおねがいいたします)で3回洗浄してください。
  • 分析する spot(又は band)を汚染されてない清潔なカミソリ、メスの刃を用いて切り抜いてください。
    ※スポット周辺の余分なゲルは出来るだけ除いてください。
  • 切り出したゲル片を1.5mlのエッペンチューブに入れしっかりとフタをしてください。
  • ※チューブにはバッファーや水などは入れずゲル片だけを入れてください。乾燥させたバンドでも構いません。
  • Gel のイメージファイルと切り出した バンド(もしくはスポット)のおおまかな分子量を記載した資料をプリントアウトしていただき、サンプルに同封してください。
    ※分子量はタンパク質同定のためのデータベース検索の際に参考にいたします。

<サービスに関する諸注意>

  • 銀染色で質量分析サンプルを調製する場合は、グルタルアルデヒドが含まれていない試薬をご利用ください。グルタルアルデヒドが入っている場合はタンパク質がゲルに架橋されるため、分析が行えなくなります。
  • 電気泳動ゲルからのPMF 同定とMALDI-TOF/TOF 同定の場合、 CBB染色では薄く染まる程度、銀染色では明瞭に染まる程度の量が必要です。CBBの場合はバンド1本以上、銀染色の場合はバンド3本以上を目安にお考えください。
  • 脱色(destaining)は行わなくても結構です。
  • 還元処理、アルキル化処理は必要ございません。
  • CAF-MALDI sequencing分析と LC-MS/MS分析はCBB染色されたタンパク質バンドが必要です。1バンドのタンパク質量が少ない場合はバンドが複数必要になります。SPOTの場合は少なくとも3-4個のスポットをお送りください。

2-DE 分析用(二次元電気泳動)サンプルの場合

  • 4X SDS sample bufferを調製します。
    ※4X SDS sample buffer(modified) 組成
    250mM Tris-HCl(pH6.8) 、8% SDS 、0.08% Bromophenol Blue
    4x SDS sample bufferは2-mercaptoethanol無しで調製する
  • sample bufferと細胞(またはタンパク質抽出液)を混合し、可溶化します。
  • 細胞の可溶化は以下の方法を推奨しております。検体量は解析の可否に大きくかかわりますので、必要量を必ず守っていただきますようにお願いいたします。

<動物組織>

検体量:20mg以上

可溶化法:300ul 4X SDS sample bufferによって破砕し、20分以上可溶化します。

<植物組織>

検体量: 200mg程度

可溶化法:液体窒素を利用して組織を粉砕し、 200ul 4X SDS sample bufferを添加して20分以上可溶化します。 (植物組織はサンプルを採取後、ただちに-80℃以下の温度で保存し、液体窒素による破砕を行ってください)

※植物組織の場合は、凍結乾燥処理したサンプルをお送りいただくことを推奨しております。凍結乾燥装置が無い場合は、ご相談ください。

<培養細胞>

検体量(細胞数):2 X 106 以上

可溶化法:細胞を遠心分離した後、上層液(培地成分)は捨て、ペレットを PBSで2-3回 洗浄し、洗浄液を取り除いたのちに300ul 4X SDS sample bufferで20分以上可溶化します。

<タンパク質抽出液>

検体量:1mg程度(Bradford法などで定量して下さい)

可溶化法:4X SDS sample bufferをサンプル量に合わせて加えてください。

※200ugで24cm large gelを用いた2-DEを1回実施できますが、以後の質量分析を考慮して1mg程度の量をお送りください。

<サービスに関する諸注意>

  • 特にご指定のない場合は、pH4-10の1次元Gelと24cmの2次元Gelを用いて解析を行いますが、その他のrangeのGelも対応可能ですので、ご希望がある場合はご連絡ください。
  • 染色はMALDI-compatible alkaline silver stainingを基本的に行いますので coomassie stainingをご希望の方はサービス依頼の際にお問い合わせください。(ゲノム解析が出来てない種につきましては MS/MS分析のために必ずcoomassie stainingを行います)
  • 結果によらず、分析を実施したところまでの費用が発生いたします。
  • 塩濃度の高いサンプルは泳動パターンが乱れる可能性がございますので、サンプル調製の際にはご注意ください。
  • 感染性のあるサンプルは処理の際に確実に不活性化していただくよう、お願い申し上げます。

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ホームページの[分析依頼]もしくは、[サービス依頼]をクリックし、ログイン画面より分析依頼サイトにログインしていただきます。分析依頼サイトでは分析を希望する解析法、サンプル数、サンプルの詳細情報などをご記入いただきます。情報を送信していただきますと、分析依頼が完了いたします。

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4 サンプルの送付

サンプルは常温でGENOMINE社にお送りいただきます。お送りいただく際には、以下のものを入れてください。

  • 解析サンプル
  • プリントアウトした分析依頼
  • 染色したサンプルのゲルイメージおよび分子量が記載されている用紙
    (切り出したゲルをお送りいただく際に必要です)

 

<サンプル送付先>

Recipient Name: GENOMINE Inc.,

Address: Rm 307, Venture Bldg, Pohang Technopark, Zigok-Dong,

Nam-Gu, Pohang, South Korea, 790-834


<送付方法>

  • MS分析用サンプル1-3個、2-DE分析用サンプル1個の場合はお客様に送料をご負担いただきます。郵便局の EMSをご利用いただくと、お安く済みます。
  • MS分析用サンプル4個以上、2-DE分析用サンプル2個以上お送りいただく場合は、TNTでGenomine着払いをご指定ください。送料はこちらで負担いたします。着払いをご利用いただく際は、下記のアカウント番号を着払いの欄にご記入ください。 Genomine TNT アカウント番号:566166

 

 

<EMSでの送付>

  • EMSの場合、小包便で内容物表記に「MS sample non hazardous」とご記載ください(※)。また、伝票下部に危険物でないかのチェック項目がありますので、必ずチェックをお願いいたします。
  • ※取り扱い窓口の担当によっても対応が変わる可能性がありますので、必ず問題が起きない事をお約束するものではございませんが、過去の事例では問題なく受領されております。

  • 下記リンクよりcommercial invoiceをダウンロードして必要事項を記入し、サンプルとともに郵便局窓口に提出してください。

commercial invoiceダウンロード

 

<TNTでの送付方法>

  • TNTで送付する場合には、ウェブからの配送申し込みになります。申し込みが完了した時点で配送に必要な書類一式がプリントアウトできるようになるので、それらをプリントアウトし、配達員に渡してください。申し込みの際の方法についてまとめた書類をこちらからダウンロードできます。
  • 発送はTNTもしくは提携配送業者がいったん東京に荷物を集め、一括して成田空港からの配送になります。23区の場合は当日15時までであれば当日成田から発送されますが、それ以降になりますと翌日発送になります。また、それ以外の地域は1日のタイムラグが生じますので、到着日を心配される方はTNTにご確認いただくことを推奨いたします。

<TNTで送付する際の注意事項>

TNTで送付いただく際には、以下の書類をご用意ください。(commercial invoiceと誓約書は下記のリンクからダウンロードできます)

 

Commercial invoice について

commercial invoiceは通関の際にお送りいただくタンパク質サンプルに商業的価値がないことを証明する為に必要な書類です。荷送人 / 輸出者の欄に顧客情報をご記入いただいたお申込者の情報を英語でご記入ください。また、通関を速やかに行うため、 DESCRIPTION OF GOODS欄には non - hazardous protein sample, no commercial valueと明記してください。

タンパク質送付誓約書について

タンパク質送付誓約書は通関の際にお送りいただくタンパク質サンプルに危険性が無い事を証明するために必要な書類です。こちらにも製品名の欄に non - hazardous protein sampleと明記してください。

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5 サンプル分析

サンプルの到着から、分析の進捗、分析の完了までの一連の状況は、ホームページにあるサービス依頼(サービス管理システム)からログインいただくことで、ご覧になれます。

<分析サービスの方針>
  • ■情報の守秘
  • GENOMINE社はサンプルを提出された組織(機関、会社)との間に非開示契約がなくても提供されたサンプルの情報についての守秘義務を有します。 書面での締結が必要な場合はお問い合わせください。

  • ■サンプルの廃棄 :
  • GENOMINE社は受託依頼者から依頼されたサンプルについての分析を終了した後、残存するサンプルがある場合には、6ヶ月間またGelの場合は1年間の保管の後に廃棄することを原則とします。

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6 分析結果の入手

サンプルの分析が完了しましたら、GENOMINE社よりお客様にe-mailで通知がございますので、メールに記載されているアドレスからサイトにアクセスしてください。該当するサービスを選択しますと、そこからデータを入手することができます。

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